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基于舌鳞癌Tca8113细胞醛脱氢酶活性不同构建差异表达基因cDNA文库
基于舌鳞癌Tca8113细胞醛脱氢酶活性不同构建差异表达基因cDNA文库
作者:
孙守娟
季平
李颖
漆小娟
邓诚
邹波
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
人舌鳞癌Tca8113
抑制性消减杂交技术
cDNA文库
肿瘤干细胞
醛脱氢酶
摘要:
目的 构建舌鳞癌Tca8113细胞系中高、低醛脱氢酶活性(high/low aldehyde dehydrogenase activity,ALDHhigh/ALDHlow)细胞差异表达基因cDNA文库.方法 用流式细胞仪检测ALDEFLUOR(R)染色的Tca8113细胞中干细胞标志物ALDH的表达,并收集ALDHhigh和ALDHlow细胞;用Trizol分别提取两亚群细胞的总RNA;用抑制性消减杂交(SSH)对2组RNA进行差异基因筛选和扩增,扩增产物与pMD18-T载体连接并转化大肠杆菌DH5α.文库扩增后,每库随机挑取24克隆进行酶切、测序及同源性分析.结果 分选得到ALDHhigh和ALDHlow两亚群细胞,其中ALDHhigh细胞的比例为2.5%;分光光度计测得ALDHhigh和ALDHlow的RNA D( 260 )/D( 280)的比值分别为1.93和1.92;构建了ALDHhigh和ALDHlow细胞差异基因cDNA双向文库,每个库约500个克隆菌落,每库随机挑选24个菌落进行PCR分析,克隆片段均 匀分布在200~700 bp,无假阳性克隆.测序结果经同源性比对分析和PubMed检索,其中与肿瘤有关的基因有SLC25A13、KLHL2、NPC1、WAPL、BARD1、Notch2、EEF2K.结论 成功构建ALDHhigh和ALDHlow细胞差异基因cDNA文库.
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方波
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增殖
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文献信息
篇名
基于舌鳞癌Tca8113细胞醛脱氢酶活性不同构建差异表达基因cDNA文库
来源期刊
第三军医大学学报
学科
医学
关键词
人舌鳞癌Tca8113
抑制性消减杂交技术
cDNA文库
肿瘤干细胞
醛脱氢酶
年,卷(期)
2012,(3)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
226-230
页数
分类号
R394-33|R394.2|R739.86
字数
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
季平
重庆医科大学附属口腔医院颌面外科
71
168
5.0
8.0
2
李颖
重庆医科大学附属口腔医院颌面外科
45
290
10.0
14.0
3
邓诚
重庆医科大学附属口腔医院颌面外科
11
32
3.0
5.0
4
孙守娟
重庆医科大学附属口腔医院颌面外科
9
13
3.0
3.0
5
邹波
重庆医科大学附属口腔医院颌面外科
10
13
3.0
3.0
6
漆小娟
重庆医科大学附属口腔医院颌面外科
6
7
2.0
2.0
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引文网络
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参考文献(0)
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二级引证文献(0)
2012(1)
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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第三军医大学学报
主办单位:
第三军医大学
出版周期:
半月刊
ISSN:
1000-5404
CN:
50-1126/R
开本:
大16开
出版地:
重庆市沙坪坝区高滩岩30号
邮发代号:
78-91
创刊时间:
1979
语种:
chi
出版文献量(篇)
15739
总下载数(次)
28
总被引数(次)
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