ARMS-PCR对棉花SNP分型的研究

• 作者: 冯文林 曲延英 柴颜军 梁维维 谢元元 郑炜佳 陈全家 马顺尧
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 单核苷酸多态性 基因分型 ARMS-PCR
• 年，卷（期）: 2013,（12）
• 页码范围: 2182-2188
• 页数: 7页
• 分类号: S562|S188
• 字数: 3964字
• 语种: 中文
• DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2013.12.004

摘要

[目的]在已知SNP的情况下,找到适合棉花SNP的简便验证方法.[方法]利用四引物扩增突变体系(tetra-primer amplification refractory mutationsystem PCR,Tetra-primer ARMS-PCR)对槔花SNP分型进行验证.[结果]根据深圳华大基因已组装的棉花转录本做为参考,分别将新海21号和新陆中36号的转录组测序样品比对到参考基因,通过SOAPsnp技术检测样品的单核苷酸多态性.棉花海陆杂交亲本的38个单核苷酸多态性位点设计出的66组SNP引物进行验证.通过优化PCR反应体系,反应条件,调整内外引物浓度和PCR体系的优化,从66组引物中扩增出11组引物,得到了良好的分型效果.[结论]四引物扩增受阻突变体系聚合酶链式反应是一种简单快捷而有效的SNP基因分形方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曲延英	新疆农业大学农学院	135	726	13.0	19.0
2	陈全家	新疆农业大学农学院	112	621	11.0	21.0
3	柴颜军	新疆农业大学农学院	6	40	4.0	6.0
4	梁维维	新疆农业大学农学院	4	20	3.0	4.0
5	郑炜佳	新疆农业大学农学院	3	15	2.0	3.0
6	谢元元	新疆农业大学农学院	2	13	2.0	2.0
7	冯文林	新疆农业大学农学院	2	6	1.0	2.0
8	马顺尧	新疆农业大学农学院	2	8	2.0	2.0