金属β-内酰胺酶TMB-1三维结构模建及活性位点的分析

• 作者: 劳兴珍 郑珩 陈姣 黄灿
• 来源期刊: 抗感染药学
• 学科: 医学
• 关键词: TMB-1 金属β-内酰胺酶(MBLs) 同源模建 分子动力学优化(MD)
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 实验与研究
• 页码范围: 184-188
• 页数: 5页
• 分类号: R915
• 字数: 3987字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-7878.2013.03-006

摘要

目的:模拟金属β-内酰胺酶TMB-1三维结构,分析其结构特点与水解活性之间的关系.方法:运用DS 2.5版软件搜索模板、序列比对和构建模型,用Ramanchandran图和3D Profile程序验证模型,经分子动力学优化与水解后氨苄西林Libdock对接,再经动力学优化后与NDM-1重叠分析模型活性位点关键残基.结果:经Ra-manchandran图和3D Profile分析,表明TMB-1蛋白模建结构较为合理；重叠分析显示其空间结构为与其他金属β-内酰胺酶类似的αββα折叠,其锌配位残基具有高度的序列和结构保守性.结论:TMB-1相比NDM-1活性位点Loop3和Loop10上氨基酸残基自由度的降低可能是造成特异水解活性重要原因之一.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑珩	中国药科大学生命科学与技术学院	106	521	13.0	17.0
2	劳兴珍	中国药科大学生命科学与技术学院	36	122	7.0	9.0
3	陈姣	中国药科大学生命科学与技术学院	7	30	3.0	5.0
4	黄灿	中国药科大学生命科学与技术学院	1	0	0.0	0.0