西洋杜鹃SRAP体系优化及遗传多样性分析

• 作者: 吴月燕 李波 许丹叶 陶巧静
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 植物学 西洋杜鹃 遗传多样性 SRAP-PCR 正交设计 体系优化 聚类分析
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 页码范围: 844-851
• 页数: 8页
• 分类号: Q946|S685.21
• 语种: 中文

摘要

以西洋杜鹃Rhododendron hybridum功能叶片为试验材料,采用改良的十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取西洋杜鹃基因组DNA,并且运用L16(44)正交试验设计,在4个水平上对影响西洋杜鹃相关序列扩增多态性(SRAP)反应的镁离子(Mg2+)浓度、Taq酶用量、三磷酸碱基脱氧核苷酸(dNTPs)浓度、引物浓度等4个因素进行了优化,确立了一套适用于西洋杜鹃的稳定可靠、重复性强的SRAP-PCR反应体系.实验发现,其最佳反应体系(20.0 μL)为:Mg2+浓度1.750 mmol·L-1,dNTPs浓度0.175 mmolL-1,Taq酶1.500×16.67 nkat,引物0.200 μmolL-1.利用该优化体系对24个西洋杜鹃花品种进行遗传多样性分析.从88对SRAP引物中筛选出10对扩增清晰且多态性高的引物,共扩增出217条带,其中多态性条带212条,多态性比率达97.35％.24个杜鹃品种的遗传相似系数变化范围为0.591～0.708,算术平均数的非加权配对算术平均法(UPGMA)聚类分析结果显示:在相似系数为0.590处将24个供试品种分为2个类群,在相似系数为0.623处又可分为2个亚群,说明该优化体系可应用于西洋杜鹃花品种鉴定及遗传多样性的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李波	浙江万里学院生物与环境学院	46	601	14.0	23.0
5	吴月燕	浙江万里学院生物与环境学院	76	900	18.0	26.0
6	陶巧静	浙江万里学院生物与环境学院	6	86	6.0	6.0
10	许丹叶	浙江万里学院生物与环境学院	1	11	1.0	1.0