苦荞SRAP分子标记体系优化与遗传多样性分析

• 作者: 令狐斌 侯思宇 孙朝霞 许冬梅 路阳 韩渊怀 黄可盛
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苦荞 SRAP-PCR 正交试验设计 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 页码范围: 37-43
• 分类号: S517
• 语种: 中文
• DOI: 10.11841/j.issn.1007-4333.2015.01.05

摘要

通过正交试验设计,比较苦荞序列相关多态性-聚合酶链式反应(Sequence related amplified polymorphism-polymerase chain reaction,SRAP-PCR)扩增反应体系的组合,选出最佳扩增体系用于苦荞SRAP分子标记进行遗传多样性分析.其中最佳SRAP-PCR反应扩增体系为Taq DNA聚合酶2U、Mg2+ 1.5 mmol/L、DNA模板75 ng、引物0.5μmol/L.从238对SRAP引物组合中筛选出20对多态性较高的引物组合,并对15个苦荞品种进行遗传多样性分析.结果表明:20对引物组合共扩增出128个位点,其多态性信息量(Polymorphism information content,PIC)值在0.66～0.95,每对引物组合扩增位点为7～13个,多态性比率平均值为81.6％,其中多态性信息量值为0.95的引物组合为me7em11、me9em4和me12em8.基于UPGMA法聚类(GS=0.78)可将15个苦荞品种划分为3大类,但这3类划分的品种没有明显的地域分布特征.