中国苦荞SSR分子标记体系构建及其在遗传多样性分析中的应用

• 作者: 吴斌 张宗文 高帆
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 苦荞 SSR 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1042-1053
• 分类号: S517
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.06.002

摘要

[目的]从分子水平优化并构建用于中国苦荞种质资源遗传多样性分析的SSR分子标记体系,为综合评价中国苦荞种质资源提供依据.[方法]以50份苦荞种质为试验材科,用正交设计法[L16(45)]筛选适用于苦荞SSR标记分析的PCR反应体系,浓度梯度检测最佳胶分离效果,并从250对不同科属作物SSR引物中筛选出19对引物进行苦荞遗传多样性分析.[结果]优化的苦荞SSR反应体系为DNA模板30 ng,Taq酶2.0 U·L-1,dNTP、引物和Mg2+终浓度分别为150 μmol·L-1、0.1μmol·L-1、2.0 mmol·L-1,总体积为25 μL,6％聚丙烯酰胺凝胶电泳检测.SSR引物筛选率为7.6％,蓼科同属甜荞的SSR引物适用于苦荞SSR扩增.19对引物共检测到157个等位变异,每对SSR引物检测到的等位变异2-11个,平均等位变异(NA)7.42个,平均多态性信息量(PIC) 0.888,平均鉴定力(DP)5.684,2对为SSR骨干引物.利用Popgen Ver.1.31软件,当遗传相似度(GS)为0.578时,50份苦荞材料被分为5个组群,聚类结果与苦荞地理分布相关性不大.四川苦荞资源组群各遗传多样性参数均最高,该区域苦荞种质资源多样性最丰富.利用骨干引物可鉴定部分近缘苦荞品种.[结论]构建的SSR分子标记体系适用于中国苦荞种质资源遗传多样性分析,甜荞SSR引物可用于苦荞SSR标记分析,TBP5和Fes2695为苦荞SSR骨干引物,50份苦荞材料遗传多样性丰富,可划分为5个组群.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴斌	中国农业科学院作物科学研究所	32	450	12.0	20.0
2	张宗文	中国农业科学院作物科学研究所	33	616	14.0	24.0
6	高帆	山西大学生命科学学院	11	50	3.0	7.0