柱花草SRAP-PCR体系优化及其遗传多样性分析

• 作者: 刘凤民 刘艾 张伟丽
• 来源期刊: 草业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 柱花草 SRAP 体系优化 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 159-168
• 分类号: S541+.903|Q943
• 字数: 8222字
• 语种: 中文

摘要

以热研2号、热研13号柱花草为试验材料,对影响SRAP标记PCR反应的模板、Mg2+、dNTPs、酶及引物浓度进行了优化,建立了适合于柱花草SRAP标记的扩增体系.反应体系具体为:模板DNA 40 ng,Mg2+ 2.5mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,Taq酶1.0U,引物0.3μmol/L,反应总体积为25 μL.采用优化的扩增体系,对9份柱花草种质材料进行了遗传多样性分析.从48对SRAP引物中筛选出14对扩增清晰且多态性高的引物,共扩增出154条谱带,其中有150条多态性谱带.多态性比率(PPB)达97.36％.应用NTSYSpc 2.1数据分析软件计算各品种间的遗传相似系数(GS),结果表明这些材料间的遗传相似系数的变化范围为0.386～0.882,平均遗传相似系数为0.631,平均遗传距离(GD)为0.369.通过UPGMA分子系统聚类法,将9份柱花草种质分为3个类群,有钩柱花草是第Ⅰ类,西卡柱花草是第Ⅱ类,热研5号、热研10号、热研13号、白花库克、热研2号、格拉姆、Tardio为第Ⅲ类.从遗传聚类图可以很明确地看出9份种源间的遗传距离及亲缘关系.对聚类结果分析显示,大部分具有亲缘关系的品种及形态学、生物学特征相近的品种聚在一类,说明聚类分析结果与系谱及生物学特征具有一定的相符性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张伟丽	仲恺农业工程学院生命科学学院	22	101	7.0	9.0
2	刘艾	仲恺农业工程学院园艺园林学院	9	63	4.0	7.0