X染色体60149273位点在脂尾（臀）和瘦尾绵羊品种中的多态性及其基因定位

• 作者: 刘守仁 李欢 杨井泉 梁耀伟 沈敏 王新华 甘尚权 高磊
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 脂尾性状 阿勒泰羊 多态性 基因型 标记基因
• 年，卷（期）: 2013,（22）
• 所属期刊栏目: 畜牧?兽医?资源昆虫
• 页码范围: 4791-4799
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.22.017

摘要

[目的]研究绵羊X染色体60149273位点在不同沉脂尾型绵羊品种中的多态性，为解析绵羊尾脂沉积性状的遗传机制提供基础数据。[方法]首先，采用PCR-SSCP分型方法检测X染色体60149273位点在不同脂尾类型绵羊品种的多态性，并借助PCR产物直接测序的方法确认各基因型相应序列，利用卡方检验的方法检测各基因型分布在不同品种中的平衡性。其次，利用生物信息方法将该SNP定位与绵羊androgen receptor（AR），并使用电子克隆的方法克隆出绵羊AR全长编码序列。同时以阿勒泰羊臀部脂肪RNA为材料，采用RT-PCR的方克隆绵羊AR第3-8外显子序列，利用生物信息学方法分析序列同源性以及序列的物种进化保守性。[结果]①PCR-SSCP结果显示，在脂尾（臀）型绵羊品种阿勒泰羊和湖羊群体中X染色体60149273位点未检出多态性，GG基因型占100%；而瘦尾（臀）型绵羊品种中国美利奴和萨福克羊群体中则出现了多态性，GG 基因型分别下降至10%和21%。②利用比较基因组学首次电子克隆出该SNP所属基因AR的全长编码区，并从阿勒泰羊臀脂mRNA中成功扩增羊源AR第3-8外显子片段，测序结果与电子克隆序列完全一致。③物种同源性比对进一步显示，AR在哺乳类动物中高度保守，哺乳动物各物种间同源性高达90%；进化树分析结果显示，牛、绵羊、海豚和猪等哺乳动物亲缘较近。[结论]首次发现绵羊AR第3内含子一处SNP在脂尾（臀）与瘦尾绵羊品种中存在较大差异，该SNP将可作为一个分子标记运用于低脂绵羊新品种的培育，同时该SNP所属AR也可作为一个重要候选功能基因应用于绵羊尾（臀）脂沉积分子机制的相关研究。