蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞表位预测

• 作者: 尹惠琼 杜杰 杨姝 章金刚 韦平 马玉媛
• 来源期刊: 中国动物传染病学报
• 学科: 农学
• 关键词: 蓝舌病毒VP7蛋白 B淋巴细胞表位 二级结构 预测
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 病毒
• 页码范围: 29-36
• 页数: 8页
• 分类号: S852.659.4
• 字数: 4800字
• 语种: 中文

摘要

根据前期试验中测得的蓝舌病病毒VP7蛋白的基因序列和推导的氨基酸序列,利用DNAStar软件和Biosun软件进行生物信息学预测,以单参数(亲水性、可及性、柔韧性、抗原性)预测为基础,结合二级结构预测来综合分析蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞表位.比较两种软件的预测结果发现,在蓝舌病病毒VP7蛋白的381个氨基酸序列中,第81～85、198～202、235～239、253～257区域有较好的亲水性、表面可及性和较高的抗原指数,并且在二级结构上含有易形成抗原表位的转角和无规则卷曲,最有可能为蓝舌病病毒VP7蛋白的B细胞线性优势表位.上述预测和判定结果表明,在蓝舌病病毒VP7蛋白序列中存在优势B细胞线型表位,为进一步合成多肽并分析已获得的VP7蛋白单抗的结合表位奠定了基础.