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摘要:
昆虫几丁质酶家族属于第18家族糖苷键水解酶,主要参与昆虫蜕皮、细胞增殖和免疫等生理过程.在7个物种基因组数据中通过BLASTP和PSI-BLAST的方法获得131条chitinase和chitinase-like的同源蛋白质,利用隐马尔科夫算法,找到了几丁质蛋白的保守模体区域.通过进化树分析,将所选的蛋白分为9组,与糖苷水解酶18催化结构域和几丁质结合结构域的特性一致.通过PAML软件计算出几丁质酶的正向选择位点,发现了豌豆蚜虫中的A.pisum xp003243674.1为一条新的几丁质酶蛋白.对深入研究昆虫几丁质酶结构与功能很有帮助.
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文献信息
篇名 昆虫几丁质酶的进化与保守性质的比较基因组学研究
来源期刊 河北科技大学学报 学科 生物学
关键词 几丁质酶 同源蛋白 进化树 模体 正向选择位点
年,卷(期) 2013,(4) 所属期刊栏目 化工、生工与医药
研究方向 页码范围 350-354
页数 5页 分类号 Q781
字数 3931字 语种 中文
DOI 10.7535/hbkd.2013yx04008
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 张屹 河北科技大学理学院 7 13 2.0 3.0
2 万张勇 河北科技大学研究生学院 1 4 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
几丁质酶
同源蛋白
进化树
模体
正向选择位点
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
河北科技大学学报
双月刊
1008-1542
13-1225/TS
大16开
河北省石家庄市裕华东路70号
1980
chi
出版文献量(篇)
2212
总下载数(次)
6
总被引数(次)
14739
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
河北省自然科学基金
英文译名:
官方网址:
项目类型:
学科类型:
论文1v1指导