从猕猴肝脏组织扩增黄嘌呤脱氢酶/氧化酶基因片段

• 作者: 叶尤松 唐东红 毕正生 王城宽 罕圆圆 罗云 黄英
• 来源期刊: 中国实验动物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 猕猴 XDH/XO基因片段 RT-PCR 肝脏组织 测序
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 57-62,68
• 页数: 7页
• 分类号: Q95-33
• 字数: 5008字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-4847.2013.05.012

摘要

RT-PCR扩增猕猴黄嘌呤脱氢酶/氧化酶(XDH/XO)基因片段,为进一步开展相关研究提供实验资料.方法 提取猕猴新鲜肝脏组织总RNA,用RT-PCR二步法进行XDH/XO基因片段扩增,对获得的目的片段进行序列测定,与GenBank上发表的人类(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)、家鼠(Rattus norvegicus)、野猪(Sus scrofa)等物种XDH/XO基因进行该序列同源性比对分析,DNAMAN软件预测该段核苷酸的氨基酸序列,InterProScan 及SWISS-MODEL工具进行XDH/XO的编码蛋白结构域及功能预测及三维结构构建.结果 RT-PCR 产物电泳检测得到了与设计大小相一致的目的条带,序列测定共测到683个核苷酸,DNAMAN软件预测该段核苷酸的氨基酸序列包括了1个编码53个氨基酸的开放阅读框(ORF),通过该软件包中Multiple alignment对目的基因片段的核苷酸序列与NCBI报道的人类、小鼠、家鼠、野猪XDH/XO基因mRNA互补的cDNA核苷酸序列同源性进行同源性比较分析,结果显示所扩增得到的目的片段与人类同源性最高,为95.6%,与小鼠、家鼠、野猪的同源性分别为85.2%、84.3%、86.1%,说明获得的基因片段是猕猴的XDH/XO基因片段,且该基因在物种间具有较高的相似性.生物信息学预测该段XDH/XO编码蛋白含有醛氧化/脱氢酶的钼喋呤结合点结构域及黄嘌呤脱氢酶结构域.结论 在体外成功扩增出猕猴XDH/XO基因片段,为进一步开展高尿酸血症致病机理研究,抗高尿酸血症新药研发奠定工作基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶尤松	中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所	14	19	2.0	3.0
2	毕正生	中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所	2	7	1.0	2.0
3	唐东红	中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所	17	94	5.0	9.0
4	罕圆圆	中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所	1	0	0.0	0.0
5	罗云		1	0	0.0	0.0
6	王城宽		1	0	0.0	0.0
7	黄英	中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所	1	0	0.0	0.0