人类管家基因和非管家基因microRNA绑定密度的比较及与3′UTR进化保守性关系的分析

• 作者: 刘哲言 卢一鸣 屈武斌 张成岗
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 生物学
• 关键词: 管家基因 非管家基因 microRNA 基于序列的预测 表达谱数据 进化分析
• 年，卷（期）: 2013,（11）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 808-813
• 页数: 6页
• 分类号: Q522
• 字数: 6578字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7644/j.issn.1674-9960.2013.11.002

摘要

目的：该研究从整体水平比较microRNA（miRNA）对管家基因和非管家基因的调控差异并研究3′UTR的进化保守性与miRNA对两类基因调控差异之间的相关性。方法通过对3个基于序列的miRNA靶基因预测软件整合分析，并结合基于miRNA-靶基因的表达谱数据相关性分析，以获得miRNA对两类基因的调控情况，同时利用phastCons保守性分值对两类基因的3′UTR区域进行多物种进化分析。结果研究发现miRNA在管家基因的3′UTR上有显著地高密度绑定，管家基因的3′UTR区域具有相对较高的序列保守性。结论该研究结果突出了miRNA对管家基因表达调控的重要作用，对于重新理解miRNA对真核生物基因表达调控作用具有一定的参考价值。