红花ω6脂肪酸脱氢酶基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 侯凯 刘千 吴卫 官玲亮 易斌 邹宇婷
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 红花 ω6脂肪酸脱氢酶 RT-RACE 亚油酸
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 372-383
• 页数: 12页
• 分类号: S565.903
• 字数: 6461字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2013.04.004

摘要

采用RT-PCR和RACE(rapid amplification of cDNA ends)技术,从红花未成熟的种子和叶片中分离到8个FAD2基因和1个FAD6基因片段,并全部提交至GenBank上.在NCBI中Blast结果显示,CtFAD2-1和CtFAD2-8与向日葵、大豆、棉花等种子特异表达的FAD2-1基因的同源性较高.而CtFAD2-2与其他作物中组成型表达的FAD2-2/CtFAD2-3有较高的相似性.将红花ω6脂肪酸脱氢酶氨基酸序列进行同源性比对,CtFAD2-1与CtFAD2-8的同源性最高,为79.9％;其次是CtFAD2-2与CtFAD2-1和CtFAD2-8,分别为70.8％和70.2％;而这3个FAD2基因与其余5个拷贝间的序列相似性均较低,在52.0％ ～61.0％之间;CtFAD6与CtFAD2之间的相似性极低,在18.0％ ～21.9％之间.红花8个FAD2均检测到内质网滞留信号,将其定位于内质网膜上,而CtFAD6 N-端检测到67bp的质体信号肽序列,将其定位于叶绿体膜上.疏水性和跨膜分析结果显示,除CtFAD2-6以外,其余FAD2均含有6个疏水区,分别跨膜4～6次.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴卫	四川农业大学农学院	135	1821	23.0	35.0
2	侯凯	四川农业大学农学院	34	182	8.0	12.0
3	刘千	四川农业大学农学院	10	91	7.0	9.0
4	官玲亮	四川农业大学农学院	8	91	5.0	8.0
6	邹宇婷	四川农业大学农学院	5	16	2.0	3.0
9	易斌	四川农业大学农学院	3	22	2.0	3.0