山核桃FLOWERING LOCUS C 同源基因鉴定与表达分析

• 作者: 杨希宏 陈芳芳 黄坚钦 黄有军
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 植物学 山核桃 CcFLC 序列分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 分类号: S664.1|Q943
• 语种: 中文

摘要

根据本课题组对山核桃Carya cathayensis花芽454测序获得的CcFLC基因的2个开放阅读框(ORF)分别设计引物并进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,获得开放阅读框大小分别为639 bp和612 bp,编码212个和203个氨基酸,GenBank登录号分别为JQ829074和JQ829075,都具有典型的MADS-box结构域,核苷酸和氨基酸序列同源性分别为78％和67％,5′端高度同源,3′端差异较大.与太行花Taihangia rupestris和梨Pyrus pyrifolia等物种的FLC-like基因的氨基酸序列同源性达到40％～57％.氨基酸疏水性分析显示,它们的羧基端都是疏水性氨基酸,而氨基端是亲水性氨基酸,大部分氨基酸残基是疏水性的.实时定量PCR结果显示:CcFLC基因的2个开放阅读框在山核桃的营养枝的幼茎、幼叶、顶芽,以及短果枝的雌花芽和雄花芽中都有表达,但相对表达量存在较大差异,同一组织中ORF1的表达丰度明显高于ORF2. ORF1表达量在茎中最高,但在叶和雄花芽的表达量最低；ORF2在雌花芽中相对表达量最高,茎中表达量最低.