甲型H1N1病毒HA、NA氨基酸序列比较及抗原性表位预测*

• 作者: 何颖 刘兆宇 刘昌文 张俊艳 李胜涛 邹泽红
• 来源期刊: 中国医学创新
• 关键词: H1N1流感病毒 抗原表位 血凝素 神经氨酸酶
• 年，卷（期）: 2013,（19）
• 页码范围: 1-3
• 页数: 3页
• 字数: 2549字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-4985.2013.19.001

摘要

目的：比较新型甲型 H1N1流感病毒分离株 HA、NA 氨基酸序列之间的差异，分析 HA、NA 蛋白可能的抗原性细胞表位。方法：从 GenBank 中选取28株世界各地的新型甲型 H1N1流感病毒分离株并下载各株 HA、NA 的氨基酸序列；使用 Clustal X 和 MEGA 2.0软件对氨基酸序列的进行进化树分析；用 Protean 软件预测 HA、NA 蛋白的 B 细胞表位；用 NetMHC Ⅱ2.2预测 T 细胞抗原表位。结果：世界范围的毒株之间氨基酸序列相对保守，HA 及 NA 均只有少数位点的变异，HA 蛋白氨基酸序列之间较 NA 蛋白氨基酸序列之间变异较大；预测 HA 蛋白具有8个 B 细胞表位和10个 T 细胞表位；NA 蛋白有12个 B 细胞表位和7个 T 细胞表位。结论：HA、NA 蛋白的少数区域抗原性相对比较稳定，可以作为检测以及疫苗研究的靶区域。