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摘要:
目的:通过计算机辅助的氨基酸定点突变及分子对接研究血型A抗原模拟多肽(EYWYCGMNRT-GC)中关键的氨基酸残基.方法:通过在线服务器PEP-FOLD构建丙氨酸突变后多肽的三维结构,通过软件Autodock Vina将多肽与血型A抗体(PDB:1jv5)进行对接,计算亲和力,通过分析亲和力的变化确定模拟多肽中的关键氨基酸残基.结果:肽EYWYCGMNRTGC与1jv5的对接最小自由能为-6.3 kcal/mol,其中E1、W3、T10、C12经丙氨酸替换后与1jv5的亲和自由能分别增加为-6.1 kcal/mol、-5.4 kcal/mol、-6.0 kcal/mol、-6.1 kcal/mol.结论:血型A抗原模拟肽EYWYCGMNRTGC中的关键氨基酸可能是E1、W3、T10、C12.
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文献信息
篇名 血型A抗原模拟肽表位分析
来源期刊 临床血液学杂志(输血与检验版) 学科 医学
关键词 血型A抗原 模拟多肽 计算机辅助分子对接
年,卷(期) 2013,(3) 所属期刊栏目 临床研究
研究方向 页码范围 379-380,383
页数 3页 分类号 R457.11
字数 语种 中文
DOI
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作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 胡丽华 219 1037 13.0 23.0
2 曹奎杰 22 134 6.0 11.0
3 方敏 8 46 5.0 6.0
4 汤兆明 10 21 3.0 4.0
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研究主题发展历程
节点文献
血型A抗原
模拟多肽
计算机辅助分子对接
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
临床血液学杂志(输血与检验版)
双月刊
1004-2806
42-1284/R
武汉市解放大道1277号
chi
出版文献量(篇)
1909
总下载数(次)
6
总被引数(次)
6787
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导