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血型A抗原模拟肽表位分析
血型A抗原模拟肽表位分析
作者:
方敏
曹奎杰
汤兆明
胡丽华
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
血型A抗原
模拟多肽
计算机辅助分子对接
摘要:
目的:通过计算机辅助的氨基酸定点突变及分子对接研究血型A抗原模拟多肽(EYWYCGMNRT-GC)中关键的氨基酸残基.方法:通过在线服务器PEP-FOLD构建丙氨酸突变后多肽的三维结构,通过软件Autodock Vina将多肽与血型A抗体(PDB:1jv5)进行对接,计算亲和力,通过分析亲和力的变化确定模拟多肽中的关键氨基酸残基.结果:肽EYWYCGMNRTGC与1jv5的对接最小自由能为-6.3 kcal/mol,其中E1、W3、T10、C12经丙氨酸替换后与1jv5的亲和自由能分别增加为-6.1 kcal/mol、-5.4 kcal/mol、-6.0 kcal/mol、-6.1 kcal/mol.结论:血型A抗原模拟肽EYWYCGMNRTGC中的关键氨基酸可能是E1、W3、T10、C12.
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篇名
血型A抗原模拟肽表位分析
来源期刊
临床血液学杂志(输血与检验版)
学科
医学
关键词
血型A抗原
模拟多肽
计算机辅助分子对接
年,卷(期)
2013,(3)
所属期刊栏目
临床研究
研究方向
页码范围
379-380,383
页数
3页
分类号
R457.11
字数
语种
中文
DOI
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姓名
单位
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G指数
1
胡丽华
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曹奎杰
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方敏
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汤兆明
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血型A抗原
模拟多肽
计算机辅助分子对接
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
临床血液学杂志(输血与检验版)
主办单位:
华中科技大学同济医学院附属协和医院
北京大学医学院血研所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1004-2806
CN:
42-1284/R
开本:
出版地:
武汉市解放大道1277号
邮发代号:
创刊时间:
语种:
chi
出版文献量(篇)
1909
总下载数(次)
6
总被引数(次)
6787
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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