植物病原细菌 hrp 基因簇比较基因组分析

• 作者: 刘彬 司贺龙 董金皋 赵斌 邢继红 陶晡
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 植物病原细菌 hrp基因簇 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 页码范围: 27-31
• 页数: 5页
• 分类号: S435.131|Q78
• 字数: 3598字
• 语种: 中文

摘要

hrp基因是植物病原细菌中一类重要的致病基因，一般成簇排列。对14种已完成全基因组测序的植物病原细菌基因组中的hrp基因簇进行了大小、G＋C含量、基因组成的BlastP比较。发现它们的大小在18～24 kb，由22～28个基因组成。欧文氏菌属和假单胞菌属的菌株中G＋C含量较低，拉尔氏菌属和黄单胞菌属菌株的G＋C含量较高。而且，各菌属的基因簇都有其独有的hrp基因，如假单胞菌属是hrpK1、hrpV、hrpA；欧文氏菌属是hrpT、hrpV、hrpA；拉尔氏菌属是hrpZ、hrpX、hrpY、hrpV；黄单胞菌属是hrpE、hrpD6、hpaA。其中，基因hrpA1、hrpA、hrpY和hrpE在假单胞菌属、欧文氏菌属、拉尔氏菌属和黄单胞菌属中均编码Ⅲ型菌毛的基因，可能在寄主和病原物识别中起重要作用。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	董金皋	河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室	210	2521	27.0	39.0
2	邢继红	河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室	33	153	6.0	11.0
3	司贺龙	河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室	45	106	6.0	7.0
4	赵斌	河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室	41	192	9.0	11.0
5	陶晡	河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室	33	444	13.0	20.0
6	刘彬	河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室	2	6	1.0	2.0