扁蓿豆冷诱导基因差异表达分析

• 作者: 云娜 伊风艳 张宇 石凤翎 蔡丽艳 高霞
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 扁蓿豆 冷诱导 cDNA-AFLP 差异表达
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 60-65
• 页数: 6页
• 分类号: Q786
• 字数: 4457字
• 语种: 中文

摘要

以直立型扁蓿豆幼苗为试验材料,采用cDNA-AFLP技术分析扁蓿豆在低温胁迫诱导下的基因表达差异.结果显示,利用筛选的64对引物组合,对0℃低温处理3～5叶期扁蓿豆幼苗的叶片cDNA进行扩增,共获得549条差异表达的转录衍生片段(TDFs).选取上调表达较好的43条片段进行克隆、测序、Blastx比对和功能分析,其中32个TDFs的蛋白序列与基础代谢、信号转导、转录因子、防御等功能有关,11个TDFs为假设蛋白、未知蛋白或没有找到一致序列.利用荧光定量PCR对3种不同上调表达差异片段进行验证,结果可从数值上更准确地显示差异片段在低温胁迫过程中的相对表达量.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	石凤翎	内蒙古农业大学生态环境学院	98	926	17.0	25.0
2	高霞	内蒙古农业大学生态环境学院	17	88	6.0	8.0
3	伊风艳	内蒙古农业大学生态环境学院	17	98	6.0	8.0
4	张宇	内蒙古农业大学生态环境学院	36	253	9.0	14.0
5	云娜	内蒙古农业大学生态环境学院	3	28	3.0	3.0
6	蔡丽艳	中国农业科学院草原研究所	8	46	5.0	6.0