秦川牛DKK1基因SNPs检测及其与体尺、肉质性状的关联分析

• 作者: 付常振 姜碧杰 昝林森 李耀坤 杨宁 皇甫一凡 郝瑞杰 马向辉 高建斌
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 秦川牛 DKK1基因 SNPs PCR-SSCP 体尺性状 肉质性状
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 376-386
• 页数: 11页
• 分类号: S823|S813.3
• 字数: 6983字
• 语种: 中文

摘要

旨在对秦川牛DKK1基因进行SNPs检测,并研究其与秦川牛体尺、肉质性状的相关性.本研究随机选择相近饲养条件下447头18～24月龄的秦川牛母牛,采用DNA直接测序技术并结合PCR-SSCP方法进行DKK1基因全区段遗传变异检测.运用SPSS16.0程序中最小二乘法拟合线性模型对DKK1基因不同基因型与秦川牛体尺(体斜长、体高、腰高、尻长、腰角宽、胸深、胸围和坐骨端宽)和肉质性状(背膘厚、眼肌面积和肌间脂肪含量)进行关联分析.经DNA测序发现秦川牛DKK1基因存在5个突变位点,分别为第一内含子G523A突变；第二内含子A999G和A1 169G突变；第三内含子C1858T突变；第四外显子A2355G突变,其为第247位氨基酸Cys→ Arg的错义突变.PCR-SSCP方法检测得到G523A和A2355G位点仅存在2种基因型；A999G、Al169G和C1858T位点存在3种基因型.卡方检验显示,G523A、A1169G和A2355G位点则处于Hardy-Weinberg极度不平衡状态(P＜0.01),而A999G和C1858T位点于检测群体中处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05).关联分析表明,秦川牛DKK1基因不同突变位点的不同基因型与体斜长、体高、腰高、尻长、坐骨端宽和背膘厚、眼肌面积、肌间脂肪含量差异显著相关(P＜0.05或P＜0.01).DKK1基因对秦川牛部分体尺、肉质性状有显著的影响,可以尝试作为秦川肉牛新品系培育的主效候选基因.