福州宦溪野生蕉(Musa spp.,AB group)CHUP1基因克隆及其生物信息学分析

• 作者: 刘炜婳 赖钟雄
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 福州宦溪野生蕉(Musa spp.,AB group) CHUP1 基因克隆 内含子分析 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 875-883
• 页数: 9页
• 分类号: S668.1
• 字数: 6598字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2013.05.014

摘要

CHUP1(chloroplast unusual positioning 1)参与了叶绿体移动信号转导过程,对植物避免光伤害及提高光合效率方面具有重要作用,并且与植物抗寒性有密切关系.本研究以福州宦溪野生蕉(Musa spp.AB group)叶片为材料,采用同源克隆的方法,分离出CHUP1基因cDNA和DNA序列,GenBank登录号分别为JX123753、JX880084,命名为Mu-CHUP1.Mu-CHUP1 cDNA全长3232 bp,ORF 2931 bp,编码976个氨基酸.福州宦溪野生蕉Mu-CHUP1 cDNA序列与小果野蕉(M.acuminata,AA Group)全基因组测序中的CHUP1 cDNA序列的相似性为84.71％;福州宦溪野生蕉Mu-CHUP10RF的DNA序列含8个内含子、9个外显子,而小果野蕉全基因组测序中的CHUP1基因组DNA序列则有11个内含子、12个外显子,两者相差较大.生物信息学预测分析表明,Mu-CHUP1磷酸化位点多达62个,并且含有3个保守结构域,可能与其行使多样性的功能有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	刘炜婳	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	10	23	3.0	4.0