浙江省人感染H7N9禽流感病毒的基因组序列分析

• 作者: 严菊英 冯燕 张严峻 徐昌平 李榛 王欣莹 茅海燕 陈寅 高见
• 来源期刊: 中华流行病学杂志
• 关键词: H7N9禽流感病毒 基因组 序列分析 进化树
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 实验室研究
• 页码范围: 604-608
• 页数: 5页
• 字数: 3742字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2013.06.016

摘要

目的 分析浙江省2013年4月初一例人感染甲型H7N9禽流感患者的病原学和基因组序列特征.方法 提取患者标本的病毒RNA并用荧光定量RT-PCR方法检测,一步法RT-PCR扩增H7N9禽流感病毒基因组的8个片段,测序并拼接出基因组序列.下载目前已经公布的H7N9禽流感病毒和其他H7、N9亚型的病毒的HA和NA序列,采用Mega 5.1软件对其进行序列比对并构建进化树.根据测序的结果分析该例H7N9禽流感病毒的序列变异情况.结果 该患者标本甲型流感、H7亚型和N9亚型均为阳性,通过扩增基因组各片段并进行测序.对血凝素和神经氨酸酶基因进行比对和进化树构建,结果显示该H7N9病毒HA基因与A/duck/Zhejiang/12/2011(H7N3)的亲缘关系最近,NA基因与A/wild bird/Korea/A14/2011 (H7N9)的亲缘关系最近.编码内部蛋白的6个基因均与中国大陆近两年的H9N2毒株最为相似.该标本的病毒HA蛋白发生了Q226L突变,而与已经公布的人感染H7N9禽流感毒株均不一致的是PB2未发生E627K突变.结论 从该份临床标本完成了检测和基因组各片段的扩增与测序.该病毒与已报道的人感染H7N9禽流感病毒同源性高,存在Q226L等重要位点的突变,但PB2未发生E627K突变.