利用高通量测序快速检测H7N9禽流感病毒及基因组序列分析

• 作者: 史套兴 安小平 徐晓蒙 王伟 童贻刚 范航 裴广倩
• 来源期刊: 安徽医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 高通量测序 H7N9禽流感病毒 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2014,（8）
• 所属期刊栏目: 基础医学研究
• 页码范围: 1033-1038
• 页数: 6页
• 分类号: R373.19|Q7
• 字数: 3649字
• 语种: 中文

摘要

目的 探索用高通量测序技术检测咽拭子样本中H7N9禽流感病毒的方法.方法 分别提取编号为106、089及024 3份样本RNA,反转录,eDNA扩增,用Ion Torrent进行高通量测序,对测序结果进行生物信息学分析.结果 3个咽拭子样本的测序结果中均能检测出禽流感病毒,拼接出的基因组序列可以进行生物信息学分析.结论 利用高通量测序技术可以快速地检测H7N9禽流感病毒,并可用生物信息学软件拼接基因组序列及进行序列分析.