量子化学方法研究丝氨酸与酪氨酸水合团簇几何构型

• 作者: 丁伟 刘国宇 吴文祥 娄燕敏 栾和鑫
• 来源期刊: 计算机与应用化学
• 学科: 化学
• 关键词: 丝氨酸 酪氨酸 量子化学 多极距法 从头计算
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 页码范围: 111-115
• 页数: 5页
• 分类号: O641-4
• 字数: 3708字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11719/com.app.chem20130201

摘要

为研究水合氨基酸几何构型,利用从头计算(ab initio),多极距法(multipole moments)等量子化学方法,在分子水平上对几何优化后的水分子,水合丝氨酸及酪氨酸团簇进行系统的比较.此外,针对目前流行的多种点电荷模型AMBER,CHARMM,OPLS,MMFF,TAFF的精确性进行了检测.结果表明:(1) ab initio得到的水分子偶极距和四极距与实验结果相一致,可以作为精确度评判标准与多极距、点电荷等方法进行比较;(2)丝氨酸与酪氨酸均可与周围水分子以氢键形式构成水合团簇,且氢键键长范围(O-O键)在2.7 (A)～2.9 (A)之间,H...O键长在1.9 (A)～2.0(A)之间,均属于中强氢键.(3)当n=1～5时,酪氨酸与水分子间均形成1∶1型氢键;n≤3时,丝氨酸与周围水分子以1∶1型氢键构成环形水合团簇;n＞3时,以2∶1型氢键构成环形水合团簇; (4)多极距法阶数L增加,平均绝对误差(mean absolute error,MAE)先降低后升高,L=5时MAE最小,结果最精确.(5)量子化学方法预测丝氨酸与酪氨酸水合团簇精确度:Multipole moments＞TAFF＞OPLS-AA＞AMBER99＞CHARMM27＞MMFF94X

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴文祥	东北石油大学石油工程学院	42	151	7.0	9.0
2	丁伟	东北石油大学石油工程学院	93	332	9.0	12.0
3	栾和鑫	东北石油大学石油工程学院	12	34	4.0	5.0
4	娄燕敏	东北石油大学石油工程学院	15	17	3.0	3.0
5	刘国宇	哈尔滨工业大学理学院	7	78	6.0	7.0