猪流行性腹泻病毒PCR检测及其M基因的遗传变异分析

• 作者: 刘爽 吴发兴 张志 李岚 李晓成 王赛赛 董雅琴
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 M基因 进化分析
• 年，卷（期）: 2013,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 13-18
• 页数: 6页
• 分类号: S852.65
• 字数: 3902字
• 语种: 中文

摘要

为了解我国猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行情况,利用套式反转录-聚合酶链反应(nRT-PCR)技术,从表现腹泻症状的仔猪粪便中扩增出6份阳性样品,测序表明,一扩PCR产物的大小为854 bp,涵盖PEDV的M基因.选择34个参考毒株基于M基因进行进化树分析,结果显示PEDV可以分为G1和G2两个基因型7个基因亚型.G1型以2007年前的经典毒株为主,包括CV777、Br1/87、KPEDV-9、JMe2和CH/S株等；G2型则以近年分离的毒株为主,包括GDXS5、JS-2004-2、PFF188、KU06RB08等.其中G2.3亚型已经成为目前世界上主要的PEDV流行毒株,包括本次检测的6株PEDV、泰国的KU06RB08及GenBank中我国和韩国2011年的流行毒株.通过同源性比较发现,这6株PEDV之间的同源性为98.2％～100％,与经典毒株CV777的同源性为97.6％～98.2％.结果表明,尽管PEDV之间的同源性仍较高,但PEDV流行毒株已经逐渐形成独特的流行进化分支.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴发兴		52	436	12.0	19.0
2	刘爽		30	181	7.0	13.0
3	张志		47	459	12.0	19.0
4	李晓成		65	578	14.0	21.0
5	董雅琴		20	89	6.0	9.0
6	李岚		9	81	5.0	9.0
7	王赛赛		4	58	3.0	4.0