禽呼肠孤病毒C-98、T-98分离株S2基因的克隆及序列分析

• 作者: 何建文 党娟 关平原 李平安 高魁
• 来源期刊: 畜牧与饲料科学
• 学科: 农学
• 关键词: 禽呼肠孤病毒 S2基因 RT-PCR 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 基础科学
• 页码范围: 18-23
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.4
• 字数: 5053字
• 语种: 中文

摘要

参考GenBank中禽呼肠孤病毒176株(ARV 176)S2基因设计引物,对禽呼肠孤病毒内蒙古地区分离株C-98和禽呼肠孤病毒天津地区分离株T-98进行总RNA的提取,以其为模板,应用RT-PCR方法扩增病毒S2基因的cDNA片段,将纯化的cDNA片段克隆到pEASY-T1载体后进行序列测定.结果表明,获得的ARV C-98和ARV T-98的S2基因全长为1 324 bp,包括15 bp的5’非编码区和58 bp的3’非编码区,阅读框位于5’端第16位核苷酸和第1 266位核苷酸之间.ARV C-98和ARV T-98分离株S2基因的核苷酸同源性很高,达到了99.8％,将C-98、T-98株的S2基因核苷酸序列和参考毒株的S2基因序列进行同源性分析,结果表明,ARV C-98和ARV T-98分离株的S2基因与参考毒株ARV 176、ARV 918、ARV 919、ARV1733、ARV GX2010、ARV S1133和DRV YJL S2基因的核苷酸同源性最高,在99.2％～99.8％之间；与参考毒株ARV 138和ARV AVS-B S2基因的核苷酸同源性在92.1％～94.1％之间；与参考毒株ARV 601SI、ARV 916和ARV 1017-1 S2基因的核苷酸同源性在87.3％～87.8％之间；与参考毒株DRV 091、DRV S12和DRV S14S2基因的核苷酸同源性在77.3％～78.2％之间；与参考毒株MRV 3、MRV 3-jin-1和MRV 3-T3D S2基因的核苷酸同源性最低,在2.4％～5.5％之间.遗传进化树分析显示:ARV C-98和ARV T-98分离株与参考毒株共分为4个遗传进化分支.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	关平原	内蒙古农业大学兽医学院	58	314	10.0	15.0
5	李平安	内蒙古农业大学兽医学院	22	151	8.0	12.0
9	何建文	内蒙古农业大学兽医学院	2	0	0.0	0.0
10	党娟	内蒙古农业大学兽医学院	3	17	1.0	3.0
11	高魁		1	0	0.0	0.0