枣结果枝核糖体蛋白的生物信息学分析

• 作者: 孟玉平 戎宏立 曹秋芬 李倩 王长彪
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 枣结果枝 EST分析 核糖体蛋白 生物信息学
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 110-114,145
• 页数: 6页
• 分类号: S665.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2013.02.02

摘要

应用生物信息学的方法对枣(Ziziphus jujuba Mill.)生长初期结果枝的cDNA文库ESTs进行了功能注释,查找核糖体蛋白基因,并对其氨基酸序列组成、基本理化性质、蛋白质二级结构、疏水性/亲水性及潜在磷酸化位点等进行了初步分析预测,旨在了解其结构特征,进而发掘枣树的优良基因.结果表明,625个ESTs中,有397个ESTs与NCBI中已知功能基因相似性较高(其中重复ESTs 77个)；将320条ESTs通过KEGG数据库进行代谢分析,得到123条ESTs的62个代谢途径.对获得的枣树24个核糖体蛋白进行分析发现,其分子量在6 931.12～32 764.44之间,α-螺旋和无规则卷曲是其主要的结构元件,多肽链都表现为亲水性,磷酸化潜在位点普遍存在于核糖体蛋白多肽链中；并构建了24个核糖体蛋白的进化树,对其分子进化进行了探讨.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孟玉平	山西省农业科学院生物技术研究中心	72	734	16.0	23.0
2	王长彪	山西省农业科学院生物技术研究中心	32	211	8.0	13.0
3	李倩	山西大学生物工程学院	40	140	7.0	9.0
7	戎宏立	山西大学生物工程学院	2	13	2.0	2.0