小鼠皮肤无绿藻感染差异表达基因的筛选

• 作者: 曾义斌 章强强
• 来源期刊: 中华医院感染学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 基因芯片 无绿藻属 差异表达 皮肤组织
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 1244-1247
• 分类号: R378
• 语种: 中文

摘要

目的 利用基因表达谱芯片筛选小鼠感染无绿藻皮肤组织的差异表达基因,探讨基因在皮肤无绿藻病中的作用,从而对皮肤无绿藻病有更新的认识.方法 12只6～8周龄雄性小鼠,随机分为两组,实验组(皮肤无绿藻感染组)和对照组(生理盐水组)各6只；分别提取免疫抑制小鼠感染无绿藻的皮肤组织和对照组皮肤组织,抽提总RNA,反转录成cDNA同时进行单色标记,和小鼠全基因表达谱芯片杂交,经过芯片扫描和数据处理,分析出差异表达的基因,并对部分差异基因采用实时荧光定量PCR的方法进行验证.结果 感染无绿藻的小鼠皮肤组织中表达差异＞2倍的基因共有9902个,其中表达上调的基因4974个,表达下调的基因4928个；生物信息学分析发现,差异基因功能主要涉及炎症反应、免疫应答、信号转导、细胞黏附等多个生物学过程；另外还发现了一些有意义的信号通路如趋化因子信号通路、Jak-STAT信号传导途径、Toll样受体信号传导途径等；差异基因的实时荧光定量PCR结果与基因芯片的结果趋势一致.结论 皮肤无绿藻病的发生涉及众多基因表达的改变,芯片技术可以有效地筛选出皮肤无绿藻感染小鼠的差异表达基因,对进一步探索皮肤无绿藻病的发病机制,有效干预或治疗皮肤无绿藻病具有重要意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾义斌	复旦大学附属华山医院皮肤科	19	131	6.0	11.0
2	章强强	复旦大学附属华山医院皮肤科	87	518	13.0	18.0