长链非编码RNA在舌鳞癌中的表达谱特征

• 作者: 盘杰 褚洪星 贾搏 赵建江 邱小玲 郑相淮 陈军 韩久松
• 来源期刊: 中山大学学报（医学科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 长链非编码RNA 舌鳞癌 lncRNA芯片
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 信息研究
• 页码范围: 469-475
• 页数: 7页
• 分类号: R78
• 字数: 4576字
• 语种: 中文

摘要

[目的]观察长链非编码RNA (lncRNA)在正常舌组织和舌鳞癌组织中表达谱的变化.[方法]利用lncRNA表达谱芯片检测技术,筛查3例舌鳞癌组织及3例正常舌组织中lncRNA表达谱的变异,通过对原始数据进行预处理达到均一化后,确定舌鳞癌组织中2倍以上变化并有显著差异(P＜0.05)的lncRNA为差异表达lncRNA,筛选出差异表达的lncRNA;分别在scc-9、cal-27、um-1和um-2共4种人舌鳞癌细胞和1种人正常舌细胞以及在35例舌鳞癌组织和12例正常舌组织中,利用实时荧光定量逆转录-多聚酶链反应(qRT-PCR)对芯片结果进行验证;对筛选所得的部分差异表达的lncRNA,利用lncRNA与mRNA特异性表达的标准化信号强度,构建基因共表达网络,并进行分析.[结果]芯片共筛选差异表达lncRNA 3590条,其中上调的共1785条,降低的共1805条;选取其中部分lncRNA,qRT-PCR进一步证实了芯片结果的准确性;共表达网络构建提示某些lncRNA可能在参与舌鳞癌发生发展过程中发挥重要调控作用.[结论]与正常舌组织比较,舌鳞癌组织lncRNA表达谱发生显著变化,提示差异表达的lncRNA可能与舌鳞癌的多种恶性表型有着密切联系.