云南花生丛枝植原体16S rRNA和核糖体蛋白基因序列分析

• 作者: 万琼莲 杨子祥 王连春 蔡红 陈海如
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 云南元谋花生丛枝 植原体 16S rDNA 核糖体蛋白基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 病原学
• 页码范围: 370-378
• 页数: 9页
• 分类号: S432.1
• 字数: 3836字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.2014.04.005

摘要

利用植原体16S rRNA基因及核糖体蛋白基因(ribosomal protein,rp)通用引物对发生在云南元谋的花生丛枝病病株DNA进行PCR扩增,并对扩增片段进行序列测定.扩增获得的云南元谋花生丛枝植原体(PnWB-YNym) 16S rDNA、16S-23S rDNA和23S DNA片段总长1 806bp,rp基因扩增片段长1 171 bp.云南株系与来源于台湾和海南的花生丛枝植原体均有较高同源性.比较16S rDNA片段,发现云南株系在5个位点上与来自台湾或海南的株系存在碱基差异,其中有1个位点的差异是云南元谋株系特异的;再分别比较核糖体蛋白rplV-rpsC 2个基因所编码的氨基酸序列,发现云南株系rpsC编码的第194位氨基酸与台湾和海南的株系存在差异.经16S rDNA片段系统进化及iPhyClassifier在线分析,表明PnWB-YNym在分类上属于16SrⅡ-A亚组成员,与候选种‘Candidatus Phytoplasma australasiae’相关;基于rp基因构建的系统进化树表明,PnWB-YNym与16SrⅡ-A亚组各成员聚为同一亚进化支(iii).

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈海如	云南农业大学植物病理重点实验室	117	990	16.0	23.0
2	蔡红	云南农业大学植物病理重点实验室	51	297	11.0	14.0
3	万琼莲	云南农业大学植物病理重点实验室	3	5	2.0	2.0
4	王连春	云南农业大学植物病理重点实验室	8	27	3.0	5.0