番茄Hsp70基因鉴定及系统发育关系分析

• 作者: 万红建 叶青静 周国治 姚祝平 李志邈 杨悦俭 王荣青 阮美颖
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 番茄 Hsp70 生物信息学 系统发育关系
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 378-385
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2014.03.0378

摘要

热激蛋白70(heat shock protein 70,Hsp70)是植物应对高温和其他胁迫环境时所产生的一类特定的应激蛋白.本文以番茄基因组数据为基础,利用生物信息学方法对Hsp70基因家族进行鉴定与分析.结果表明,番茄至少含有22个Hsp70基因成员,蛋白质序列长度为210-890个氨基酸之间,具有0～12个内含子;具有4对重复基因;滑动窗口分析结果表明,这些基因中的一些区段(或者位点)可能受到正选择的压力.此外,序列比对发现这些Hsp70基因家族成员具有多个保守基序;染色体定位发现他们不均匀分布在番茄的11条染色体上;系统发育关系揭示番茄和拟南芥Hsp70基因家族成员可以分为4组,每组成员数目是变异的,并且存在3对旁系同源基因和7对直系同源基因,表明Hsp70基因家族在番茄和拟南芥分化之前就已经存在.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王荣青	浙江农业科学院蔬菜研究所	1	21	1.0	1.0
2	万红建	浙江农业科学院蔬菜研究所	1	21	1.0	1.0
3	李志邈	浙江农业科学院蔬菜研究所	1	21	1.0	1.0
4	叶青静	浙江农业科学院蔬菜研究所	1	21	1.0	1.0
5	阮美颖	浙江农业科学院蔬菜研究所	1	21	1.0	1.0
6	周国治	浙江农业科学院蔬菜研究所	1	21	1.0	1.0
7	姚祝平	浙江农业科学院蔬菜研究所	1	21	1.0	1.0
8	杨悦俭	浙江农业科学院蔬菜研究所	1	21	1.0	1.0