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YST鉴定卡与焦磷酸测序鉴定酵母样真菌的应用评价
YST鉴定卡与焦磷酸测序鉴定酵母样真菌的应用评价
作者:
公衍文
张玉娥
李继霞
胡成进
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
酵母菌
DNA,核糖体间隔区
序列分析,DNA
摘要:
目的 评价Vitek2 Compact YST鉴定卡与焦磷酸测序分析鉴定临床分离酵母样真菌的能力.方法 采用Vitek2 Compact YST鉴定卡和焦磷酸ITS1区测序分析回顾鉴定了2011年度济南军区总医院临床分离的酵母样真菌.焦磷酸测序法不能鉴定到种的菌株用Sanger法ITS1区测序复核.YST与焦磷酸测序鉴定结果不一致的菌株用API 20C复核.结果 分离自本院2011年临床送检的各类微生物培养标本的酵母样真菌共282株.ITS1区反向焦磷酸测序分析除3株只能鉴定到相似菌种外,其余菌株均能明确鉴定到种,且与其代表参照序列的同源性均为100%.焦磷酸测序法未能鉴定到种的3株菌,Sanger法测序分析仍然不能完全区分.YST卡未能鉴定的有7株,低分辨率(即鉴定百分率<80%)的有14株,另有6株鉴定错误,鉴定符合率为90.4%,不同种类的酵母样真菌YST卡的鉴定符合率不同.结论 焦磷酸测序法ITS1区反向测序分析能够完成绝大多数临床分离酵母样真菌的菌种鉴定;Vitek 2 Compact YST卡鉴定基本满足了临床工作需要,但要注意规范标准操作,定期进行室内质控.对一些少见菌种还需结合其分离部位、菌落及菌体特点等综合判断其鉴定结果正确与否.
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文献信息
篇名
YST鉴定卡与焦磷酸测序鉴定酵母样真菌的应用评价
来源期刊
中华检验医学杂志
学科
关键词
酵母菌
DNA,核糖体间隔区
序列分析,DNA
年,卷(期)
2014,(4)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
290-293
页数
4页
分类号
字数
3884字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2014.04.012
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
胡成进
济南军区总医院实验诊断科
192
858
15.0
20.0
2
公衍文
济南军区总医院实验诊断科
53
310
9.0
14.0
3
李继霞
济南军区总医院实验诊断科
18
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张玉娥
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DNA,核糖体间隔区
序列分析,DNA
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中华检验医学杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1009-9158
CN:
11-4452/R
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区宣武门东河沿街69号
邮发代号:
2-71
创刊时间:
1978
语种:
chi
出版文献量(篇)
7229
总下载数(次)
38
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