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从蛋白质和转录水平鉴定类猪圆环病毒P1存在ORF2和ORF3
从蛋白质和转录水平鉴定类猪圆环病毒P1存在ORF2和ORF3
作者:
何孔旺
姚火春
温立斌
王凤芝
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
P1
ORF2
ORF3
RT-PCR
RACE
免疫组化
摘要:
确定类猪圆环病毒P1存在开放阅读框ORF2和ORF3;采用Trizol 法,提取类猪圆环病毒 P1分子克隆转染PK-15细胞的总RNA,纯化之后,分别用P1 ORF2和 ORF3特异性引物进行RT-PCR,应用AxyPrepTM DNA 凝胶回收试剂盒回收PCR 产物,转化Trans5α感受态细胞,挑取单菌落,经PCR检测为阳性后测序。同时,利用rapid-amplification of cDNA ends (RACE)技术分别扩增P1病毒 ORF2和 ORF3的5′-与3′-末端。另外,根据P1 ORF2和ORF3的序列预测其B细胞抗原表位,采用标准的逐步固相合成法合成表位肽,与载体蛋白KLH偶联后,免疫新西兰大白兔制备抗 P1 ORF2和ORF3的多克隆抗体。采用常规间接ELISA法检测分离血清效价,包被抗原用合成肽,450 nm 波长下测定,血清抗体效价为S/N≥2.1的血清最高稀释度。然后,用P1双拷贝分子克隆转染PK-15细胞,通过免疫组化方法对该多抗与P1的反应性进行检测,同时利用实时荧光定量PCR方法检测转染细胞中P1的拷贝数。利用ORF2和ORF3特异性引物对P1 RNA 进行的RT-PCR,均能扩增出目的片段,回收测序大小分别为111 bp和128 bp,分别与P1 ORF2和ORF3进行同源性比较,序列同源性均为100%;RACE技术分析,得到P1 ORF2的5′-和3′-RACE 末端分别为第11位(G)和第168位(T),P1 ORF3的5′-和3′-RACE 末端分别为第285位(T)和第579位(A)。根据预测结果,合成肽的氨基酸序列分别为ORF2:CLSRLPQSERPPGRW和ORF3:CVYPKVRERRVLKMP;用ORF2和ORF3表位肽与载体蛋白KLH 的偶联物免疫新西兰大白兔制备的多克隆抗体效价均达到1﹕512000以上,并且能够与P1病毒发生特异性显色反应,应用蓝色DAB显色试剂盒染色结果为紫蓝色,多数在细胞浆,少数在细胞核,而对照组细胞无显色反应。定量PCR检测结果显示,P1可以在转染P1双拷贝分子克隆的PK-15细胞中复制,并且转染后104 h 增殖量达最大。通过转录分析和免疫组化试验分别从转录和蛋白质水平上证实了类猪圆环病毒P1存在ORF2和ORF3。
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内容分析
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文献信息
篇名
从蛋白质和转录水平鉴定类猪圆环病毒P1存在ORF2和ORF3
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
P1
ORF2
ORF3
RT-PCR
RACE
免疫组化
年,卷(期)
2014,(14)
所属期刊栏目
畜牧?兽医?资源昆虫
研究方向
页码范围
2863-2871
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2014.14.016
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
姚火春
南京农业大学动物医学院
90
614
11.0
23.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
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ORF2
ORF3
RT-PCR
RACE
免疫组化
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
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学科类型:
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