羊传染性脓疱病毒湖北分离株CBP二级结构及其细胞表位的预测

• 作者: 崔成 赵苗苗 黎摄儿 黎满香
• 来源期刊: 中国动物传染病学报
• 学科: 农学
• 关键词: 羊传染性脓疱病毒 毒力因子趋化因子结合蛋白 二级结构 细胞表位 预测
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 页码范围: 19-25
• 页数: 7页
• 分类号: S852.659.1
• 字数: 4125字
• 语种: 中文

摘要

参照GenBank中羊传染性脓疱病毒（Orf virus, ORFV）的毒力因子趋化因子结合蛋白（chemokine-binding protein， CBP）基因的核苷酸序列设计合成1对特异性引物，以羊传染性脓疱病毒湖北分离毒株的DNA为模板，提取总DNA。采用PCR方法特异扩增该基因片段，得到CBP基因序列。通过网络平台的SOPMA服务器和DNAStar软件预测ORFV CBP蛋白的二级结构；综合利用DNAStar软件、二级结构预测及ABCpred方案预测羊ORFV CBP蛋白的B细胞表位；分别采用人工神经网络法（ANNA）和在线程序预测ORFV CBP蛋白的细胞毒性T细胞和辅助T细胞的抗原表位。结果显示，ORFV CBP蛋白的二级结构主要包括α-螺旋、β-转角、无规则卷曲和β-片层4种类型，分别为α-螺旋占24.64％、β-片层占22.14％、β-转角占3.39％、无规则卷曲占49.29％；有7个优势B细胞表位，7个细胞毒性T细胞表位和3个辅助T细胞表位。本研究为ORFV诊断方法的建立、单克隆抗体的制备及表位疫苗的研制提供了理论依据。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黎满香	湖南农业大学动物医学院	64	282	9.0	14.0
2	黎摄儿	湖南农业大学动物医学院	3	3	1.0	1.0
3	赵苗苗	甘肃农业大学动物医学院	4	5	2.0	2.0
4	崔成	湖南农业大学动物医学院	3	2	1.0	1.0