羊传染性脓疱病毒NZ2毒株CBP蛋白结构分析与表位预测

• 作者: 常攀峰 成伟伟 杨明 赵子惠 陈伯祥
• 来源期刊: 中国动物检疫
• 学科: 农学
• 关键词: 羊传染性脓疱病毒 CBP蛋白 生物信息学 结构分析 表位预测
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 技术支撑
• 页码范围: 76-82,87
• 页数: 8页
• 分类号: S851.3
• 字数: 2683字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-944X.2019.12.016

摘要

本研究应用生物信息学方法,以ORFV NZ2毒株的CBP蛋白氨基酸序列为研究对象,对CBP蛋白的理化特性、亲水性、跨膜区、信号肽、二级结构、三级结构、B细胞表位和T细胞表位进行了预测分析.结果显示,CBP蛋白的相对分子质量为31.17989 kDa,理论等电点为4.68,半衰期为30 h,稳定系数为43.06,脂肪族指数为81.78,总平均亲水性为-0.383.CBP蛋白为亲水性蛋白,无跨膜区,不属于跨膜蛋白,存在信号肽;二级结构中α螺旋、β折叠、β转角、无规卷曲分别占38.11％、33.91％、5.94％和10.48％,三级结构形似倒立的哑铃,上下对称.筛选出了6个优势B细胞表位、3个CTL细胞表位,无Th细胞表位.CBP蛋白为亲水性膜外蛋白,细胞表位较少,在细胞膜外为ORFV逃避宿主免疫反应发挥作用.本研究为CBP蛋白的功能研究与ORFV的致病机制研究提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨明		60	206	8.0	12.0
2	陈伯祥		50	112	6.0	8.0
3	成伟伟		6	2	1.0	1.0
4	赵子惠		4	1	1.0	1.0
5	常攀峰		6	4	1.0	2.0