下一代测序数据的质量控制研究

• 作者: 冯祖仁 刘圣 高山
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 工学
• 关键词: 下一代测序 高通量测序 数据处理 质量控制
• 年，卷（期）: 2014,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 377-380
• 页数: 4页
• 分类号: TP31
• 字数: 4338字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7644/j.issn.1674-9960.2014.05.014

摘要

目的：对下一代测序数据质量控制的几个主要问题进行分析，设计数据清理和质量控制软件，为下游的数据分析提供保障。方法基于Bioconducter 软件包，开发了一个数据清理软件（ Fastq_clean ）。结果该软件在一组已发表的菊花转录组数据集上测试，得到了清理后的测序数据，同时输出了质量控制信息。结论该软件在充分利用Illumina序列特征的基础上，可以非常精确地去除低质量残基、接头、rRNA和病毒等污染，最大限度保留了高质量数据。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯祖仁	西安交通大学系统工程研究所	102	1951	20.0	41.0
2	高山	南开大学生命科学学院	9	45	3.0	6.0
3	刘圣	西安交通大学系统工程研究所	1	3	1.0	1.0