大黄鱼肿瘤坏死因子受体基因(TNFR)的克隆及其在各组织和副溶血弧菌感染下的表达

• 作者: 刘家富 孙从正 张子平 王艺磊 谢芳靖 韩坤煌 黄贻涛
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 大黄鱼 肿瘤坏死因子受体(TNFR) 副溶血弧菌 组织表达 定量PCR
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 333-342
• 页数: 10页
• 字数: 6706字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2014.03.009

摘要

肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)与肿瘤坏死因子受体(TNF receptor,TNFR)超家族在机体的先天免疫和获得性免疫方面都发挥重要作用.本研究从本实验室构建的大黄鱼(Larimichth ys crocea)EST(expressed sequence tag)数据库中筛选出TNFR(LcTNFR)基因片段,利用SMART-RACE技术克隆出大黄鱼Lc TNFR基因cDNA全序列,全长2 016 bp,其中5'非翻译区(untranslated region,UTR)64 bp,3'非翻译区602 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)1 350 bp.ORF编码449个氨基酸(GenBank登录号:KF432416).预测的蛋白质等电点为5.47,分子量为49.7 kD.对LcTNFR蛋白三维结构进行分析发现,其含有6个α螺旋,不含β折叠.Blast比对分析显示,与斑马宫丽鱼(May landia zebra)的TNFR 10B-like氨基酸序列一致性最高,达74％;与斑马鱼(Danio rerio)卵巢型TNFR一致性较高,达51％;与鲫鱼(Carassius auratus)TNFR Ⅰ的一致性为47％.鱼类TNFR进化树分析进一步表明,LcTNFR与TNFR 10B-like、TNFR Ⅰ及卵巢型TNFR聚为一大支.荧光定量PCR结果显示,TNFR基因在大黄鱼各组织中均有表达,在卵巢的表达水平最高,显著高于精巢及其它组织;其次在免疫相关组织脾脏也有较高的表达.副溶血弧菌(Vibrio parahaemol yticus)感染后的第2天和第4天,LcTNFR基因在大黄鱼脾脏组织中的表达量达到最高,显著高于对照组(P＜0.05),到第8天逐渐回落到对照组水平.本结果可为大黄鱼免疫学研究及抗病相关分子标记的开发提供参考依据.