两种弧菌感染大黄鱼免疫相关基因的SNP位点分析

• 作者: 孙明洁 张娜 徐善良 鲍宝龙 龚小玲
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鳗弧菌 副溶血弧菌 大黄鱼 转录组 免疫基因 SNP
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 水生生物疾病与防治
• 页码范围: 772-781
• 页数: 10页
• 分类号: S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.12024/jsou.20190402623

摘要

为了探究大黄鱼(Larimichthys crocea)免疫相关基因的SNP与弧菌抗性关系,分别利用鳗弧菌(Vibrioanguillarum和副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)人工感染大黄鱼.对感染前后抗感群体的转录组进行高通量测序、筛选并分析其抗病差异:(1)筛选氨基酸的非同义突变SNP位点在抗鳗弧菌组有17个,而抗副溶血弧菌组的有28个;(2)一代测序验证结果发现,染色体NW_011323507.1上白细胞介素6受体基因(IL-6R)第91 196位碱基G突变为C,导致缬氨酸突变为亮氨酸,该位点G/C在抗鳗弧菌组、对照组样本之间突变基因型CC频率分别为12.5％和0,呈显著性差异(P＜0.05);(3)补体Clq/肿瘤坏死因子相关蛋白9(CTRP9)基因在染色体NW_011323975.1上的35 665位碱基突变(A-G),在副溶血弧菌抗感易感群体中突变位点基因型GG频率分别为37.5％和0,呈极显著性差异(P＜0.01).结果 表明,IL-6R-91196-G/C位点突变与大黄鱼抗鳗弧菌有关联,CTRP9-35665-A/G位点突变与大黄鱼抗副溶血弧菌有关联,这为大黄鱼抗弧菌群体的选育提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐善良	宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室	102	907	15.0	25.0
2	鲍宝龙	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	39	200	8.0	12.0
3	龚小玲	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	24	123	6.0	10.0
4	张娜	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	3	26	2.0	3.0
5	孙明洁	上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	1	0	0.0	0.0