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甜瓜花器官发育相关基因的电子克隆及表达分析
甜瓜花器官发育相关基因的电子克隆及表达分析
作者:
王洋洋
王霞
盛云燕
翁益群
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
甜瓜
转录组测序
花器官
基因表达
摘要:
以厚皮甜瓜(Cucumis melo)‘WI998’(纯雌系)与‘TopMark’(雄全同株)配制杂交组合获得的RIL6群体为材料,对分离后代雌雄异花同株,雄全同株,完全花植株及纯雌株进行转录组测序,利用生物信息学分析方法,获得花器官发育相关基因序列Un16008,命名为Cm Ts2.该序列位于甜瓜第12条染色体上,长度1 842 bp,119 ~ 832之间存在一个包含237个氨基酸的最大开放式阅读框,成熟蛋白分子量为25 358.8 D,该蛋白不稳定系数为21.6,脂肪系数是99.11,平均亲水系数为0.078.通过Blast比对发现该基因与多种作物Tasselseeds2(TS2)基因具有高度同源性,其中与黄瓜Tasselseeds2基因同源性高达96%.通过实时荧光定量PCR检测,发现该基因在甜瓜雌雄异花同株花和叶片中表达量均高于其它性别类型植株,在纯雌株中表达量最低,说明该基因可能参与甜瓜花器官发育,尤其是雌花发育的过程.
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文献信息
篇名
甜瓜花器官发育相关基因的电子克隆及表达分析
来源期刊
园艺学报
学科
农学
关键词
甜瓜
转录组测序
花器官
基因表达
年,卷(期)
2014,(2)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
349-356
页数
分类号
S652
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.0513-353X.2014.02.017
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
盛云燕
黑龙江八一农垦大学农学院黑龙江省寒地作物种质改良与栽培重点实验室
9
76
4.0
8.0
5
王霞
黑龙江八一农垦大学农学院黑龙江省寒地作物种质改良与栽培重点实验室
103
353
9.0
14.0
6
王洋洋
黑龙江八一农垦大学农学院黑龙江省寒地作物种质改良与栽培重点实验室
7
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甜瓜
转录组测序
花器官
基因表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
园艺学报
主办单位:
中国园艺学会
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
0513-353X
CN:
11-1924/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
82-471
创刊时间:
1962
语种:
chi
出版文献量(篇)
6617
总下载数(次)
13
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