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摘要:
目的:筛查恒河猴 samhd1基因编码区单核苷酸多态性( coding-region single nucleotide polymorphism, cSNP),研究其对蛋白结构和功能的影响。方法提取恒河猴外周血RNA,RT-PCR扩增,测序比对,确定基因编码区变异位点;通过蛋白质结构分析软件对该蛋白结构进行分析;使用SNaPshot方法筛查138只恒河猴基因背景。结果序列比对发现5个非同义突变位点C15G (2.17%)、C320T (6.88%)、G547A (13.41%)、A552T (4.35%)、T839C (17.39%);其中除C15G外的其它四个cSNP位点均处于SAMHD1蛋白重要结构域上,且G547A、A552T、T839C三个cSNP位点改变SAMHD1蛋白二级结构,可能影响SAMHD1蛋白功能。结论恒河猴samhd1基因编码区存在三个可能影响SAMHD1蛋白功能的cSNP位点,为后续研究提供了参考信息。
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文献信息
篇名 恒河猴 samhd1基因编码区多态性及其对蛋白结构和功能的影响
来源期刊 中国比较医学杂志 学科 医学
关键词 SAMHD1 cSNP 蛋白质结构 功能 恒河猴
年,卷(期) 2014,(4) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 1-4
页数 4页 分类号 R33
字数 2667字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1671.7856.2014.004.001
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SAMHD1
cSNP
蛋白质结构
功能
恒河猴
研究起点
研究来源
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国比较医学杂志
月刊
1671-7856
11-4822/R
16开
北京市朝阳区潘家园南里5号
1991
chi
出版文献量(篇)
4463
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15
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25033
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