恒河猴 BST-2基因编码区单核苷酸多态性及其对蛋白结构和功能的影响

• 作者: 丛喆 熊圣文 王卫 董志会 陈霆 骆杨 魏强
• 来源期刊: 中国比较医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: BST-2 cSNP 蛋白质结构 恒河猴
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 20-24
• 页数: 5页
• 分类号: R-332
• 字数: 3386字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671.7856.2015.007.005

摘要

目的：筛查恒河猴BST-2基因编码区单核苷酸多态性（ coding-region single nucleotide polymorphism， cSNP），研究其对蛋白结构和功能的影响。方法提取恒河猴外周血RNA，RT-PCR扩增，单克隆测序比对，确定猴BST-2的cSNP位点；通过蛋白质结构分析软件对蛋白结构进行分析；比较不同基因型猴体内SHIVSF162 p3复制水平的差异。结果序列比对发现8个非同义突变位点；经Psipred软件预测，其中G41A、T128C、C129和A333C cSNP位点可影响BST-2蛋白二级结构。在SHIVSF162 p 3感染平台期，参考基因型猴（ DLQ）病毒复制水平要高于GLQ型猴（P ＜0.05），其他基因型猴之间无显著差异。结论 cSNP （G41A）可能影响BST-2的抗病毒功能，这为后续研究提供参考信息。