森林草莓全基因组MADS-box转录因子基因的鉴定及凤梨草莓果实FaMADS1基因克隆

• 作者: 周厚成 康兆茹 李刚 赵霞 郭蔼光
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 草莓 MADS-box 转录因子 生物信息学 FaMADS1基因
• 年，卷（期）: 2014,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1630-1638
• 页数: 9页
• 语种: 中文

摘要

本文利用生物信息学方法对森林草莓(Fragaria vesca)基因组数据库中MADS-box基因的数量、结构类型、序列特征及染色体定位进行分析。结果表明,获得70个含SRF-TF结构域的森林草莓FvMADS基因, DNA长度289~14596 bp,编码66~1437个氨基酸残基,有21个FvMADS没有内含子,在7条染色体上呈不均匀分布；68个FvMADS蛋白序列含有保守基序Motif 1,最佳匹配序列为“RQVTFSKRRNGLLKKAYELSVLCDAEVALIIFSSRGKLYEF”。另外,从栽培品种‘丰香’草莓果实中克隆了FaMADS1基因,该基因属于MADS-box基因家族, cDNA全长1167 bp,编码区750 bp,推导编码249个氨基酸,具有MADS结构域和K-box结构域。