水稻细菌性谷枯病菌的分子鉴定及16S rDNA序列分析

• 作者: 兰波 周求根 徐沛东 李湘民 杨迎青
• 来源期刊: 江西农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻细菌性谷枯病 颖壳伯克氏菌 16S rDNA 克隆 序列分析 系统进化
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 植保科学
• 页码范围: 760-765
• 页数: 6页
• 分类号: S435.11.4
• 字数: 2241字
• 语种: 中文

摘要

为准确鉴定水稻细菌性谷枯病病原菌，并明确其分类地位，本研究利用16S rDNA通用引物对该病菌进行了PCR扩增，克隆了其16S rDNA片段，并基于该序列对该病菌进行了分子鉴定，进而通过序列比对与系统发育分析，研究了其16S rDNA片段与近缘菌的序列差异及系统发育关系。结果表明：水稻细菌性谷枯病菌各菌株均能扩增得到1600 bp左右的条带；BLAST比对结果显示，其序列与颖壳伯克氏菌（ Burkholderia glumae）同源率为100％，将其鉴定为颖壳伯克氏菌（ B．glumae）；B．glumae与B．metallica、B．stabilis、B．cepacia、B．vietnamien-sis、B．plantarii、B．gladioli及B．cocovenenans的16S rDNA序列存在明显的差异性区域，主要集中在180～210 bp、440～470 bp、580～590 bp、640～650 bp、1000～1040 bp、1130～1150 bp和1240～1250 bp。 B．glumae与B． plantarii、B．cocovenenans及B．gladioli的亲缘关系较近，聚为一个组群，其它菌株则聚为另一个组群。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨迎青	江西省农业科学院植物保护研究所	33	208	10.0	13.0
2	李湘民	江西省农业科学院植物保护研究所	73	531	14.0	18.0
3	兰波	江西省农业科学院植物保护研究所	53	356	11.0	16.0
4	徐沛东	江西省农业科学院植物保护研究所	6	30	4.0	5.0