芹菜中转录因子基因AgDREB1的分离与表达研究

• 作者: 孙曙光 李梦瑶 熊爱生 王枫 许海峰 邵天恒
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 芹菜 DREB 转录因子 基因克隆 非生物胁迫
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 19-27
• 分类号: S636.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/j.issn.1000-2030.2014.06.004

摘要

DREB类转录因子是植物AP2/ERF转录因子家族中一个重要的亚家族,参与植物对逆境的应答,是植物适应逆境的重要调节因子之一.本文从不同品种芹菜中分离DREB类转录因子基因,并研究其表达情况,以进一步研究芹菜中非生物胁迫逆境调控.基于芹菜(Apium graveolensL.)转录组数据,分别从2个芹菜品种‘津南实芹’和‘文图拉’中克隆得到一个编码芹菜DREB类转录因子的基因AgDREB1.采用生物信息学方法对AgDREB1的氨基酸组成、理化性质、进化关系、空间结构等进行了分析.通过实时定量PCR方法对‘津南实芹’和‘文图拉’中AgDREB1基因的表达进行分析.结果表明:来源于‘津南实芹’和‘文图拉’的AgDREB1基因全长分别为495和492 bp,分别编码165和164个氨基酸.芹菜中AgDREB1转录因子等电点约为9.64,包含1个α螺旋和3个β折叠结构,进化关系上属于DREB亚族中的A5组.芹菜AgDREB1转录因子与其他物种的DREB转录因子具有较高的一致性.实时定量PCR分析表明,AgDREB1基因在‘津南实芹’和‘文图拉’根中的表达较高,对低温、高温、干旱和盐胁迫等非生物胁迫有响应.结论:从芹菜中克隆获得一个与逆境相关的DREB类转录因子基因AgDREB1,通过基因表达分析发现,芹菜中AgDREB1基因在根中表达最高,而且该基因与芹菜非生物胁迫相关.