水稻抗逆相关基因的分子进化分析

• 作者: 宋晓军 张艳萍 谢凯斌 金萍
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 水稻 抗逆相关基因 进化 选择压力
• 年，卷（期）: 2014,（10）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1027-1035
• 页数: 9页
• 字数: 5829字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2014.1027

摘要

植物在进化过程中为了适应外界环境，已经具有一套完整的抵抗外界特殊环境的调控系统。但是，关于水稻抗逆相关基因的分子进化方面的研究还未见报道。文章通过Plant Tolerance Gene Database数据库，获得22个水稻抗逆相关基因。利用比较基因组学和生物信息学方法对水稻抗逆相关基因的进化动态进行研究，结果表明水稻抗逆相关基因在低等植物中比较保守；随着植物的不断进化和生存环境的改变，其基因数量也随之增加。具有相似抗性功能的基因往往具有相似的基因结构和基序(motif)结构。文章还发现4个保守motif 的存在：HRDXK、DXXSXG、LLPR和GXGXXG(X代表任意氨基酸)。在GSK1、RAN2抗逆基因中发现了3个特有的motif结构：GSK1特有的P-rich motif，RAN2特有的G-rich motif和E-rich motif。推测这些保守的motif结构与基因的抗逆功能密切相关。进化速率分析结果表明，尽管植物抗逆性相关基因在进化过程中受到较强的纯化选择作用，但是仍然有50%的抗逆性相关基因存在正选择位点。这些正选择位点的存在有可能为基因适应外界环境变化提供了重要的物质基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张艳萍	青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物生物技术重点实验室	19	180	6.0	13.0
2	宋晓军	青岛农业大学生命科学学院山东省高校植物生物技术重点实验室	4	7	2.0	2.0
4	金萍	南京师范大学生命科学学院比较基因组学与生物信息学实验室	4	37	2.0	4.0
7	谢凯斌	南京师范大学教师教育学院	1	3	1.0	1.0