烟草类异黄酮还原酶基因家族的分子克隆

• 作者: 吕俊 李春俭 林叶春 柴友荣 王三根 陈伟 高维常
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 烟草 类异黄酮还原酶 分子克隆 基因家族
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 页码范围: 23-34
• 分类号: S572
• 语种: 中文
• DOI: 10.11841/j.issn.1007-4333.2014.06.04

摘要

为揭示类异黄酮还原酶(Isoflavone reductase-like,IRL)在烟草次生物质合成和生理功能中的作用,从品种龙里红花烟中克隆普通烟草IRL(NtIRL)基因家族2个成员的全长cDNA和gDNA序列,完成了生物信息学分析、Southern杂交和RT-PCR等分子鉴定.NtIRL1基因为1 946 bp,全长cDNA为1 257 bp;NtIRL2基因为2 089 bp,全长cDNA为1 261 bp.NtIRL1和NtIRL2蛋白均为310个氨基酸,分子质量分别为34.652和34.650 ku,等电点分别为5.58和5.78.2个蛋白可能发生磷酸化等翻译后修饰,无信号肽,定位于细胞质,但有可能通过跨膜域与质膜发生联系.预测这2个蛋白的K8～G88为AdoHycase(c109931)保守域,I9～T239为NmrA(pfam05368)保守域,并具有PIP类型蛋白的所有保守性基序和活性残基.预测2个蛋白的二级结构以α螺旋和延伸链为主;三级结构具有PIP酶典型特征,中间有1个催化裂口.BLAST和系统发生分析进一步证实Nt IRL家族属于PIP大家族,与IFR的关系比PCBER和PLR更近.Southern blot杂交也证明,普通烟草基因组中有且只有2个IRL基因存在.半定量RT-PCR结果显示,NtIRL1和NtIRL2均在根中优势表达,在地上部各器官中表达很弱或无表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈伟		63	706	16.0	23.0
2	王三根	西南大学农学与生物科技学院	56	1101	17.0	32.0
3	吕俊	西南大学农学与生物科技学院	18	296	7.0	17.0
4	李春俭	中国农业大学资源与环境学院	49	1483	21.0	37.0
5	柴友荣	西南大学农学与生物科技学院	22	191	6.0	13.0
6	高维常		33	196	8.0	11.0
7	林叶春		23	175	8.0	12.0