炭疽芽胞杆菌中CRISPR位点

• 作者: 冯尔玲 刘先凯 惠一鸣 焦磊 王东澍 王恒樑 王秉翔 韩少波 高志奇
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 规律成簇间隔短回文重复序列 炭疽芽胞杆菌 分子分型
• 年，卷（期）: 2014,（11）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1362-1368
• 分类号: Q933
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.2014.11.014

摘要

[目的]考察炭疽芽胞杆菌中规律成簇的间隔短回文序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)位点多态性情况及基于CRISPR位点多态性的分子分型方法是否在炭疽芽胞杆菌分型中适用.[方法]下载NCBI数据库中6株炭疽芽胞杆菌基因组并截取其中CRISPR位点片段序列.根据炭疽芽胞杆菌内CRISPR位点信息,设计相关引物,以193株炭疽芽胞杆菌基因组为模板PCR扩增CRISPR位点片段,测序.本地Blast比对截取序列及测序结果,查看CRISPR位点在炭疽芽胞杆菌中的多态性情况,并比较炭疽芽胞杆菌与蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌内CRISPR位点情况.[结果]炭疽芽胞杆菌内CRISPR位点不存在多态性.[结论]基于CRISPR位点多态性的分子分型方法不适用于炭疽芽胞杆菌分型,但可以用于区分炭疽芽胞杆菌与蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌.