鸡组蛋白去乙酰化酶3的重组表达与结构信息学分析

• 作者: 刘兵 宋铭忻 殷昊 蔡建平 袁金钱 路义鑫 马雪婷 龚振兴
• 来源期刊: 中国兽医科学
• 学科: 农学
• 关键词: 鸡 HDAC3 同源建模 分子对接
• 年，卷（期）: 2014,（10）
• 页码范围: 1066-1072
• 页数: 7页
• 分类号: S858.31
• 语种: 中文

摘要

为比较柔嫩艾美球虫(Eimeria tenella)与鸡的组蛋白去乙酰化酶3(histone deacetylase 3,HDAC3)蛋白质序列和结构差异,以发现和筛选E.tenella HDAC3 (EtHDAC3)的特异性抑制物.用RT-PCR方法从杂交黄羽肉鸡的肠上皮细胞克隆ChHDAC3基因,以原核表达载体pMAL-C2X构建重组质粒pMAL-C2X-ChHDAC3,经双酶切和测序鉴定后转化大肠杆菌Transetta,进行IPTG诱导表达.使用Swiss-Model对ChHDAC3和EtHDAC3进行同源建模,比较分析ChHDAC3和EtHDAC3的活性位点.利用Autodock 4.2进行分子对接,研究抑制剂Apicidin与ChHDAC3、EtHDAC3结合模式的差异.结果显示,克隆的ChHDAC3基因的ORF由1 287个核苷酸组成,编码428个氨基酸,能在大肠杆菌中进行可溶性表达.构建的ChHDAC3和EtHDAC3的三维模型均由8个串联的β折叠和11个α螺旋组成,其活性位点高度保守,仅在表面识别区有1个氨基酸的差异.Apicidin与EtHDAC3有更低的结合能,提示Apicidin对EtHDAC3具有更强的抑制活性和选择性.