利用简单重复序列（SSR）标记分析太湖稻区现代粳稻品种的遗传多样性

• 作者: 孙海燕 徐港明 杨志刚 沈宗根 王小虎 端木银熙 罗兵 高阳
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 粳稻 简单重复序列(SSR)标记 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2014,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1502-1513
• 页数: 12页
• 字数: 7209字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2014.12.005

摘要

太湖地区有丰富的粳稻(Oryza satiua ssp. japonica)种植资源，随着品种大面积推广应用，育种材料的遗传基础趋窄，相似性增高，使粳稻育种突破困难。本研究利用分布于水稻(Oryza satiua L.)12条染色体上的24对简单重复序列(simple sequence repeat, SSR)引物对太湖地区的42份粳稻品种进行遗传多样性分析。结果表明，有23对SSR引物在42份粳稻材料间表现出多态性；23对引物共检测到105个等位基因，每对SSR引物检测到等位基因为2~8个，平均为4.57个，有效等位基因共有56.43个，平均每个位点为2.45个。每个多态位点的多态信息含量(polymorphism information content, PIC)变幅为0.0830~0.8079，平均为0.4966；每个粳稻材料多态性位点数的变幅为6~19，等位基因总数的变幅为27~55；42份粳稻品种间的遗传相似系数变幅为0.391~0.990，平均为0.610，遗传相似系数在0.50~0.80之间的材料占全部的74.45%，供试材料相似度高；非加权配对算术平均法(unweighed pair group method with arithmetic mean；UPGMA)聚类结果显示，遗传相似系数为0.50，42份粳稻材料可以分为两个类群，一个类群包含19份常规粳稻，另一个类群包括其他23份杂交粳稻。结果显示，太湖地区的粳稻品种总体上遗传背景相似度高，遗传多样性不够丰富，育种工作有待进一步加强新的基因资源引进和利用，创新水稻育种材料。本研究结果为新品种选育提供技术支持和理论根据。