鸡钙离子结合分子伴侣Calreticulin的结构与功能预测及组织表达特性

• 作者: 于东 曹嫦妤 李楠 李金龙 王丽丽 王伟 龚都强
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 鸡 Calreticulin 结构与功能 组织表达特性 进化关系
• 年，卷（期）: 2014,（19）
• 所属期刊栏目: 畜牧?兽医?资源昆虫
• 页码范围: 3874-3882
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2014.19.016

摘要

【目的】揭示鸡组织细胞内质网(endoplasmic reticulum, ER)中关键Ca2+结合分子伴侣钙网蛋白(calreticulin, CRT)的结构与功能及组织表达特性。【方法】应用Laser Gene软件，通过比对Gene bank已登录的12种脊椎动物CRT核苷酸及氨基酸序列以分析其进化关系，利用生物信息学方法预测鸡CRT蛋白的结构与功能，并采用荧光定量RT-PCR方法检测CRT在鸡30个不同组织中的表达特性。【结果】同源性分析结果显示：鸡与其他11个物种CRT基因核苷酸序列中，鸡与兔核苷酸序列同源性最高，为78.7%，与虹鳟的同源性最低，为70.5%；氨基酸序列中，鸡与蛇的亲缘关系最近，为85.0%，与虹鳟的亲缘关系最远，为69.0%，与鼠、猕猴、人、兔、猪、牛和非洲爪蟾蜍的亲缘关系也相对较近，并均在80.1%及以上。蛋白结构与功能预测结果为：鸡CRT由404个氨基酸组成，相对分子质量46.8802 kD，理论等电点为4.41，负电荷氨基酸残基数为102，正电荷氨基酸残基数为53，分子式为C2074H3107N543O684S9，鸡CRT具有22个疏水区域，其C端与N端具有很高的疏水性，而C端的亲水性要强于N端，且形成α1(7-17)-α2(22-25)-β1(26)-β2(38-41)-β3(50-54)-β4(69-70)-β5(75-82)-β6(92-99)-β7(110-114)-β8(129-133)-β9(144-151)-β10(171-178)-β11(183-187)-β12(314-322)-β13(326-332)-α3(337-348)-α4(350-375)-α5(377-379)-α6(395-401)的二级结构。CRT蛋白属于跨膜蛋白，存在信号肽，且为分泌蛋白，酶分类属于EC 3.2.1.55或EC 3.4.24.68。组织表达检测结果表明：CRT基因在鸡各组织中广泛表达，其中在回肠、腺胃和十二指肠等组织中表达量较高，且高出肾脏（对照）20倍以上。【结论】鸡CRT核苷酸及氨基酸序列在12种脊椎动物物种中具有相对保守性，鸡CRT为跨膜分泌蛋白，为酸性蛋白，属于α-N-阿拉伯糖苷酶或Tentoxilysin，催化α-L-阿拉伯糖苷内的终端非还原性α-L-阿拉伯呋喃糖苷残基的水解，作用于α-L-阿拉伯呋喃糖苷、含（1,3）和/或（1,5）糖苷键的阿拉伯聚糖、阿拉伯木聚糖和阿拉伯半乳聚糖，能与糖类分子及Ca2+特异性结合，可监控糖蛋白组装折叠及Ca2+调控，且在消化系统中发挥重要作用。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王丽丽	东北农业大学动物医学学院	53	459	12.0	19.0
2	王伟	东北农业大学动物医学学院	81	315	10.0	14.0
3	李金龙	东北农业大学动物医学学院	77	346	11.0	14.0
4	龚都强	东北农业大学动物医学学院	16	43	4.0	6.0
5	李楠	东北农业大学动物医学学院	23	58	4.0	7.0
6	曹嫦妤	东北农业大学动物医学学院	4	6	2.0	2.0
7	于东	东北农业大学动物医学学院	1	1	1.0	1.0