对基因组内不同序列分布差异进行量化的探讨

• 作者: 崔跃华 张岩波 李治
• 来源期刊: 中国卫生统计
• 关键词: 基因组序列 分布差异 Kolmogorov-Smirnov检验 图心 数值模拟
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 554-558
• 页数: 5页
• 字数: 3736字
• 语种: 中文

摘要

目的 针对DNA词频分析中序列分布问题,探讨对基因组内不同序列的分布差异进行量化的可行性.方法 该研究采用数值模拟的方法对Kolmogorov-Smirnov检验的统计量和累积概率曲线下图形的图心进行了比较.结果 随着样本含量的增加,两个指标的离散趋势逐渐减小,但其集中趋势并没有受到明显影响,且不同的分布集中于不同的位置;当样本含量为100时,所能判别的最小统计量差异约为0.1,图心差异约为0.02;使用统计量指标时,需采用两个基准分布才能将5个待测分布分开,而图心指标可以直接将5个待测分布分开.结论 两个指标都可以看作分布差异的量化指标,但在大多数情况下样本含量应该大于100;当需要在同一坐标系表示不同分布时,图心可能是一个较好的选择.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张岩波	山西医科大学公共卫生学院医学统计学教研室	128	812	15.0	21.0
2	崔跃华	山西医科大学公共卫生学院医学统计学教研室	2	2	1.0	1.0
6	李治	山西医科大学公共卫生学院医学统计学教研室	6	29	2.0	5.0